医院设有基础医疗部、公共卫生科、综合科及办公室等一部两科一室。基础医疗部门诊部设有急诊、内科、外科、全科、妇科、耳鼻喉科、眼科、口腔科、中医康复科（下设中医诊室、中药房、煎药室、激光治疗室、牵引室、针灸治疗室、按摩室、理疗室、功能锻炼室）等科室，能够满足社区居民常见疾病的检查诊断与治疗。基础医疗部住院部拥有病床45张，配备有呼吸机、除颤仪、急救车等全套急救医疗设备及标准化手术室，能进行常见病的诊治和开展常规手术治疗。公共卫生科设有儿保室、妇保室、计划免疫室、体检中心、健康教育室、计划生育办公室、卫生应急办公室、卫生协管室等。综合科下设药房、检验科、放射科、心电图室、B超室、胃镜室。办公室下设收费室、财务室、行政库房。此外，中心管辖有武南、712所、省农科院、狮南等四个社区卫生服务站。